Para o VMWare, você pode tentar instalar a partir do disco diretamente, mas escolhendo instalar a partir de uma unidade física. e escolha (/ dev / cdrom).
ATUALIZAÇÃO: Como você está sentindo falta de uma unidade física, tente rasgar a iso usando algum outro software ou certifique-se de ter desmarcado qualquer coisa dos sinalizadores no disco.
Você também pode copiar o conteúdo em um pen drive e fazer com que a caneta seja inicializável usando o BOOTREC.EXE. Eu nunca tentei isso com o 2008 R2, mas eu fiz isso com o Win7 Ultimate. Deve ser a mesma broca.