Procure arquivos estranhos no sistema de arquivos /:
cd /
ls -l
Você vê arquivos extras? Caso contrário, verifique em subdiretórios diretamente na partição raiz.
Isso significa verificar todos os subdiretórios, mas não em / dev, / boot nem / home.
Se você não reconhecer os arquivos que você pode excluir, você precisará enviar a saída de "ls -l" e talvez possamos ajudá-lo com isso.