Deixe seu aplicativo de favoritos exportar seu conteúdo completo como arquivos .URL (possivelmente na pasta). Em seguida, basta arrastar e soltar todos os arquivos .URL para a aba de marcadores abertos no Firefox. Eu não sei o aplicativo, mas eu vi exporta em JSON para que você possa usar o php para ler o arquivo JSON e atravessar e gerar os arquivos .URL (que são exatamente como arquivos ini )
Pessoalmente, mantenho todos os meus favoritos como arquivos .URL e, em seguida, gero páginas da Web a partir dos diretórios (por exemplo, este: link : eu sincronizo meus arquivos. Arquivos URL com o Dropbox no servidor e no servidor eu gero essas páginas).
(alternativa é escrever um aplicativo que percorra o banco de dados sqlite db do firefox e digite todos os urls)