Eu tenho uma situação parecida, minha solução é inicializar o Linux (Debian) do SSD e executar o Windows em uma instância virtual usando o VirtualBox. Eu configurei uma partição grande para / home (no seu caso talvez o disco rígido inteiro de 2 TB?) E guardei o arquivo W7 virtual na minha pasta de usuário.
Na configuração do Virtualbox para minha instância do W7, configurei a pasta "/ home / [user] / Documents" como compartilhada com a montagem automática. Nesta pasta eu também coloquei a pasta de perfil Thunderbird / Icedoves para que eu possa apontar para isso e ver as mesmas contas de e-mail tanto no Debian quanto no W7
A única desvantagem até agora é que eu não encontrei uma maneira de redirecionar w7 pasta especial "Meus Documentos" para este compartilhamento (eu coloquei um atalho na pasta original "Meus Documentos")
OT: Alguma idéia sobre isso?