Quando o 'make menuconfig' é executado, você simplesmente edita um arquivo de configuração.
No final da edição, você precisa emitir 'make' para efetivar a configuração. É sempre necessário executar 'make' para fazer efeito de suas configurações.
O problema é que você está tendo erros que não tem nada relacionado à configuração que você acabou de fazer. Seu sistema tem algum problema que você precisa resolver antes de tentar compilar um kernel. E deixe-me dizer: esses problemas são muito comuns.