Estou um pouco atrasado, mas a meta-distribuição Gentoo seria uma ótima escolha. Com base em minha própria experiência, eu o chamaria de "Linux From Scratch facilitado" e tem algumas das melhores documentações que já vi.
Você começa com um conjunto muito pequeno de programas pré-compilados para sua arquitetura de CPU que pode ser imediatamente recompilado se desejado, possui um gerenciador de pacotes que se preocupa com dependências e permite que você personalize cada aspecto de como os programas são compilados, e você também pode compilar seu próprio kernel, o que é incrivelmente útil para sistemas pequenos e / ou embarcados. Você também pode compilar drivers fora do kernel para poder suportar quase todo o hardware imaginável enquanto carrega apenas os drivers que você precisa, mantendo o sistema pequeno e rápido durante o tempo de execução. O Gentoo também usa o Open RC por padrão, que é muito simples e incrivelmente personalizável.
Infelizmente, há uma curva de aprendizado muito íngreme (mesmo para aqueles experientes com o Linux), mas a documentação é uma das melhores que já vi e você basicamente seria capaz de construir sua própria distro sem se preocupar com o gerenciamento de pacotes e dependências.