Não tentei, mas acho que você estaria melhor com duas pastas portáteis, ambas configuradas para AllowMultipleInstances no arquivo FirefoxPortable.ini em FirefoxPortable \ Other \ Source. Depois de editar o arquivo, salve-o e dê outra chance.
Eu notei quando o Firefox portátil é aberto, então o Firefox regular é lançado, ele realmente lança o Firefox portátil novamente. Por exemplo, o Firefox portátil tem o acréscimo de No Scripts e o Firefox regular (instalado em Arquivos de Programas ou onde) tem o Ad Block Plus instalado, então se eu abrir o Fire Fox portátil e o Firefox normal, tenho certeza de que o computador abriu uma nova janela para o Firefox portátil porque ele não tem Ad Block Plus e não tem scripts. Existe uma maneira de ter as duas versões do Firefox abertas ao mesmo tempo? Isso é ruim para fazer?
Não tentei, mas acho que você estaria melhor com duas pastas portáteis, ambas configuradas para AllowMultipleInstances no arquivo FirefoxPortable.ini em FirefoxPortable \ Other \ Source. Depois de editar o arquivo, salve-o e dê outra chance.
Você tentou usar -no-remote e -profile <path> como parâmetros para a segunda chamada. (Fazendo isso da linha de comando e criando e editando um atalho para o Windows respectivo).
Sem -no-remote, qualquer 2º, 3º "opening" abre apenas uma nova janela do perfil do firefox já aberto, não importa o que seja, não importa, o que -profile diz ... (acredito, também não importa se versões portáteis ou instaladas).