O que você precisa saber está documentado aqui: link
Leia a seção "Cenários de uso de armazenamento de dispositivos raiz"
Nos passos 5 + 6:
Check the size of the root device on the instance. The increased size of the root device is not apparent yet. This is because the file system does not recognize the increased size on the root device.
Resize the file system.
Se você estiver fazendo muitas dessas instâncias, convém fazer isso para uma instância base / vanilla e salvá-la como uma nova AMI privada. Você pode usar isso para iniciar novos nós em seu cluster, em vez do público que você está usando.