O Action Center confia no programa (o AV) para se "registrar", ele não executa nenhuma etapa ativa para descobrir se um programa em execução é um antivírus e está atualizado. Se o malwarebytes não envolver a API do Action Center, nada que você possa fazer fará com que o Windows ache que é um antivírus. Para se livrar dos avisos, altere as configurações do Centro de Ação para não monitorar AVs.