Isso é possível. Eu mesmo sou usuário de DVORAK. aqui está como:
1. faça o login em um de seus gerenciadores de janelas. mudar para DVORAK. despeje o layout com este comando:
xmodmap -pke>dvorak.map
2. carregue o dvorak.map no seu arquivo X init. ~ / .xinitrc
xmodmap /path/to/dvorak.map