Sim, reformate a unidade X:
para que ela use a totalidade do espaço em vez de ser "expandida" (o que parece que você fez). Embora tecnicamente falando, a única coisa que isso pode afetar é o tempo de leitura, já que as 2 partições estão sendo "spaneadas" como 1 e você tem um arquivo MUITO grande em várias camadas / HDDs (possíveis tempos de leitura mais altos em um nível baixo). >
Em um nível alto, isso não deve afetar nada, já que basicamente tudo que você fez foi aumentar o tamanho de X:
de 300GB para 680GB, então, em toda a realidade, você decide se quer mover o VDI na unidade de backup (que eu recomendo que você faça de qualquer maneira) e, em seguida, reformatar / copiar através de VDI.
Espero que ajude