Isso é basicamente o equivalente a baixar um software de um site e executá-lo no Windows, mas o IIUC é potencialmente mais inseguro porque este novo PPA poderia publicar uma versão mais recente de um programa que você não pretendia obter deles, tornando obsoleta pacote que você tem e enganando o seu gerenciador de pacotes para 'atualizar' para ele. Espero que alguém me corrija se eu estiver incorreto sobre isso.
Tudo se resume a isto: Você confia na fonte?