Existem muitos mecanismos que o Steam
pode usar para identificar um computador em particular - a 'impressão digital do navegador' do Google, por exemplo - mas, no caso de uma VPN, a maneira mais fácil de saber é provavelmente verifique o endereço IP que você vê quando se conecta.Quando você usa uma VPN, o endereço IP que seu ISP atribui à sua máquina é oculto e o endereço IP do provedor de VPN é usado. É muito provável que o Steam esteja avisando que a conta em que você está logado nunca fez isso antes.
O Stema deve enviar um e-mail com um número mágico para entrar, o que "confirmará" que o endereço IP que você está usando para acessar o Steam é realmente você. Depois de inserir o número no Steam, ele deve impedir que o aviso apareça novamente.
É claro que o provedor de VPN pode optar por atualizar seu endereço IP de tempos em tempos, portanto você pode achar que precisa repetir o processo, de vez em quando.