Ao vencer, o clone do nível fs não funcionará. Você precisa obter uma cópia setor-por-setor dos discos rígidos. Se você não tiver acesso físico ao sistema, será difícil. Eu tentei isso com um truque iscsi sobre vpn, mas se você tiver sorte, existem ferramentas direcionadas para este trabalho também. Com vss (cópia de sombra de volume) você pode enganar o seu sistema para fazer uma cópia de si mesmo para o seu disco rígido local, mas também precisa de sorte.
Fazer uma cópia a partir de uma systrm em execução produz erros de sistema de arquivos sempre, e algumas vezes muito sujos, mas com sorte você pode consertá-los com o chkdsk. Era como se o seu sistema tivesse um strong desligamento.
Segundo problema: se você tem o sistema clone verificado / reparado em seu disco local, você precisa inicializá-lo. As janelas não sentirão apenas a falha grave, mas a substituição total do ambiente de hardware. Janelas mais recentes podem sobreviver com boas chances, mas win2k3 ainda não. Embora não seja impossível, especialmente se você usar a mesma placa-mãe e o tipo de CPU do seu clone, como no original.
Boa sorte! E não se esqueça de rezar: -)