Depende do comando que você usa para extrair.
Se você escolher "extrair aqui", obterá exatamente o que deseja.
Se, no entanto, você realmente não quiser os nomes das pastas em seu arquivo, poderá fazer o seguinte:
for /d %%X in (*) do "c:\Program Files-Zipz.exe" a "%%X" ".\%%X\*"
Observe o .\%%X\*
. Isso excluirá o próprio nome do diretório.