Como sugerido por @FrankThomas, isso foi causado por uma extensão de privacidade chamada Priv3 . Eu instalei isso há muito tempo e ele não parece ter sido atualizado desde então. Desativando esta extensão, tudo está funcionando novamente.
Eu também uso o Ghostery para bloquear o bloqueio de rastreadores nos dias de hoje, e acho que é fazendo um trabalho melhor.
Depois de um pouco de investigação, descobri que o Priv3 bloqueia os cookies do joindiaspora.com quando um tweet foi incorporado, como em este post . É por isso que não tive o problema o tempo todo, mas apenas quando alguém postou um tweet no meu stream. A subpágina de Flattr que sofre com esse problema também contém um tweet incorporado.