Essa é uma boa pergunta. É porque é baseado nas mesmas ferramentas de pacote que o apt-get e outros usam. Estes são projetados de uma forma que espera que você forneça todos os pacotes a serem instalados e, em seguida, o resto é automático. Isso é muito bom na maioria dos casos, mas para o Centro de Software, isso causa alguns problemas. Você precisaria primeiro selecionar os pacotes que deseja instalar e, em seguida, clicar em um botão para realmente baixá-los e instalá-los, ou ter que enfileirar os aplicativos e, em seguida, fazer o download e instalar um por um. Isso proporciona uma experiência de usuário muito melhor se você estiver instalando um aplicativo do que ter que usar esses cliques extras, mas também é irritante quando você está "fazendo compras".
É possível consertar isso, então espero que, no futuro, isso seja corrigido, mas isso significa recriar ou reescrever ferramentas existentes, então não acho que tenha prioridade muito alta.
Deixe-me elaborar:
Um pacote pode depender de outros pacotes. Se esses pacotes não estiverem disponíveis, o pacote não poderá ser instalado. Portanto, ferramentas como o apt-get primeiro baixam todos os pacotes que você pede e todos os pacotes dos quais eles dependem, etc., e então instalam todos eles. Então você normalmente forneceria todos os pacotes que você queria de uma só vez, e eles primeiro seriam baixados e depois instalados.
Quando você escolhe instalar um aplicativo no centro de software, geralmente quer que ele inicie o download e a instalação imediatamente. Mas, para garantir que tudo esteja em ordem, apenas uma instalação pode ser feita a qualquer momento. É por isso que quando você instala um aplicativo, você precisa esperar até que o aplicativo seja completamente baixado e instalado antes que o próximo download e instalação possam começar.
Isto pode ser corrigido por não usar o apt-get para instalar os pacotes, mas sim baixar os pacotes manualmente e então usar o dpkg para instalá-los assim que estiverem prontos. Você ainda não conseguiria instalar dois pacotes simultaneamente, mas seria capaz de iniciar o download de novos pacotes enquanto as instalações iniciadas anteriormente estivessem sendo concluídas. Em alguns casos, isso pouparia algum tempo, por isso é uma boa ideia. Mas na maioria dos casos, isso realmente não importa, então o esforço é melhor focado em outros lugares.