A primeira coisa que eu verifico é garantir que a sua ordem de inicialização tenha o HD no topo da BIOS. Dessa forma, se você deixar o CD ou o thumbdrive, ele não inicializará a partir deles primeiro.
Em segundo lugar, certifique-se de que, ao reinicializar, você remova a mídia extra (o CD de inicialização e / ou os pendrives). Se você definiu sua ordem de inicialização, isso não importa, mas é sempre bom restringir as opções.
E a verificação final é verificar se você está tentando instalar a partir de um disco de atualização. Uma nova instalação pode ser feita a partir de um disco de atualização, mas ele falhará na primeira vez, reinicializará e passará por todo o processo novamente. Ele vai funcionar o segundo passe para que você possa verificar isso também.
Desde que você esteja seguindo todos os prompts para a instalação, o Windows deve cuidar do restante até a configuração e o particionamento do disco rígido. Uma coisa que você poderia fazer se você realmente quisesse (mas eu não acho que você precisa) é inicializar de um sistema operacional diferente (Hiren's, Ubuntu, etc ...) e limpar / limpar o HD de lá. Isso fará com que você tenha um HD em branco.