Process explorer permite suspender / retomar processos, embora, naturalmente, você precise testá-lo no cenário específico.
Como alternativa, é um pouco uma solução alternativa, mas você provavelmente poderia obter algum software que emularia o mouse jiggles- Mouse Jiggler sugerido aqui e deve fazer o truque. Você pode, alternativamente, trabalhar de alguma maneira mecânica para fazê-lo.