O sistema DCF deve ser formatado como FAT, seja FAT32 ou exFAT (para seus cartões), dependendo do que a câmera suporta. Eu tiraria tudo dos cartões e usaria a máquina Windows para formatá-la como FAT32 (um simples clique com o botão direito do mouse em Meu computador) e ver se a câmera é capaz de usá-la. Se for, então isso deve funcionar.
A velocidade de transferência de arquivos parece lenta, mas é totalmente viável, dependendo da classe de velocidade do Cartão SD. Um cartão SD de classe 2 transfere 6 GB de arquivos por volta dessa taxa. Se o cartão SD é uma classe mais alta do que isso, também poderia ser a interface da câmera. De qualquer forma, você deve ser capaz de conectar o SD diretamente ao computador se a câmera aceitar uma partição FAT32 simples.