Não. Se você quiser recuperar o sistema de arquivos (pastas, arquivos, etc), então você precisa usar outras ferramentas, que podem reparar o sistema de arquivos em si. O sistema de arquivos e os arquivos são armazenados em diferentes locais no disco. Como o sistema de arquivos mantém registros de onde encontrar arquivos e para qual diretório eles pertencem, os arquivos estão simplesmente em algum lugar no disco e podem ser fragmentados ou não. Photorec simplesmente está tentando encontrar arquivos e faz sentido usar, se o sistema de arquivos não é reparável. (assim diretórios são perdidos)