A ferramenta que você está usando para alterar a configuração provavelmente está chamando apenas uma API do Windows para fazer a alteração. Então, qual ferramenta você está usando para mudar a configuração - essa é a que você assiste.
Não seria mais fácil,
- exportar o registro
- altere a configuração
- exportar o registro
- compare as duas exportações para descobrir o que mudou