Usando um modelo simples para criar um arquivo para cada host:
$template DynaFile,"/var/log/%HOSTNAME%"
*.* -?DynaFile
Fonte: Como separar os arquivos de log pelo nome do host do dispositivo de envio?
Não tenho certeza se a propriedade certa a ser usada neste caso é 'hostname', 'source' ou 'fromhost', mas pelo meu entendimento de a documentação das propriedades qualquer uma delas funcionará no seu caso.