Eu tive o mesmo problema com uma inicialização lenta e usei o WireShark para investigar o que o FileZilla está fazendo. Descobri que estava usando chamadas SMB (Samba) para consultar todos os arquivos e pastas no último caminho local que eu tinha aberto antes de fechar o FileZilla. Então, se o seu caminho era uma unidade mapeada como x: \ dir1 \ dir2 \ dir3 quando você fechou, ele irá consultar todos os arquivos e pastas no root (), então todos os arquivos e pastas em \ dir1, \ dir1 \ dir2 e finalmente \ dir \ dir2 \ dir3 quando você reabri-lo. Isso é um monte de atividade lenta e no meu caso demorou cerca de um minuto ou mais para ser concluído. Minha solução foi inserir c: \ como o diretório local antes de fechá-lo. Da próxima vez que você iniciar, ele será aberto quase imediatamente.