Eu também tive esse problema. Parecia ocorrer após uma atualização, eu poderia adicionar novas contas e desativar as antigas, mas incapaz de remover contas antigas usando as janelas adequadas. Eu finalmente descobri que as informações da conta pareciam estar armazenadas no diretório
/home/$USER/.config/libaccounts-glib/ (replace $USER with your username.)
Existem 3 arquivos nas contas. * ; Eu removi todos eles, reiniciei o computador e descobri que todas as contas on-line desapareceram. Depois, recriou as novas contas manualmente, conforme necessário.
Esta é uma abordagem um pouco pesada, por isso, se você usá-lo, eu recomendo que você faça uma cópia dos arquivos antes de removê-los desse diretório.