Eu faria isso de fora do sistema operacional em execução, ou seja, inicializar um computador e montar o stick lá.
Então você pode particionar a unidade inteira. Você pode usar fdisk se quiser uma ferramenta de linha de comando unix, < um href="/ questions / tagged / gparted" class="post-tag" title="mostre perguntas marcadas com 'gparted'"> gparted se você quer um GUI unix ou algo como Partition Magic se você estiver rodando Windows para limpar todo o USB, incluindo a partição de inicialização.