O Acrobat Reader possui várias opções de escala na caixa de diálogo de impressão ("Nenhum", "Reduzir para área imprimível", etc.). Certifique-se de que ambos os PCs estejam configurados para "Nenhum".
Outra possibilidade é o tamanho do papel. Se um padrão do PC for A4 e o outro for Carta, qualquer uma das configurações de "ajustar à página" do Acrobat produzirá saídas ligeiramente diferentes. Isso ocorre porque A4 é 16 mm mais longo que Letter, mas 6 mm mais estreito.