Abra o Firefox e, no menu, vá para Ferramentas - > Opções - > Avançado - > Ver certificados.
Você pode ver, gerenciar e excluir seus certificados de lá.
Além disso, supondo que você esteja usando o Windows Vista +, é possível ir para %AppData%\Mozilla\Firefox\Profiles
e excluir (ou renomear) os arquivos cert8.db
e cert_override.txt
em cada um dos perfis.