Seu laptop pode não dissipar o calor com rapidez suficiente, de modo que o seu sistema está sobrecarregando a CPU e a GPU, dando a você um impacto direto no desempenho.
Outra causa raiz pode ser uma versão ruim do Flash Player. Atualize para a versão mais recente. Teste se você tiver o mesmo problema usando HTML5 e não Flash no YouTube: link