você tentou sair e fazer login novamente? O problema pode ser uma versão baseada em sessão, uma reinicialização completa do sistema, e seria melhor tentar primeiro, determinar se o problema é baseado na sessão, em vez de reiniciar o sistema inteiro (o que no Linux não deveria ser requerido).
Normalmente, a alteração deve ser aplicada automaticamente, mas isso pode ser um problema na sua sessão, difícil de ser informado sem mais informações no momento. Você adicionou ou fez alterações na sessão da área de trabalho, em outras palavras, modificações em itens como Unity ou GNOME-Shell?