O problema com a configuração do log corrompido é abordado neste artigo
Resumindo:
- editar
/usr/sbin/tomcat6
- remova os comentários evitando a carga de
/etc/tomcat6/tomcat6.conf
Mas acho que mais da configuração não está em bom estado.
Verifique geralmente a versão do seu pacote tomcat6. Estou suspeitando que está desatualizado.
Veja Tomcat6 Changelog - a versão atual é 6.0.36 . Portanto, verifique se você pode obter um pacote mais recente ou melhor - instale-o manualmente a partir da página de download do Tomcat .