Eu tive uma versão completa de varejo (não OEM) do Windows 7 x64 Ultimate instalado em um PC por cerca de um ano. O SP e todas as muitas atualizações que o MSFT emitiu nesse ínterim foram aplicadas. Se a unidade de inicialização for transferida para outro PC com uma placa-mãe diferente, como sua unidade de inicialização, o SP e todas essas atualizações precisarão ser reinstalados?
Os service packs e atualizações ainda estão no próprio sistema operacional. Mudar de placas-mãe é como mudar de hardware. Eu tive sucesso variado fazendo este tipo de movimento, mas o meu tempo mais recente foi com o Windows 7 e foi bastante suave. No XP, eu faria backups, sacrificaria alguns sacudidelas e tremeria quando ligasse. Às vezes, funcionaria e às vezes precisa de um novo formato.
Você pode perder seus service packs se acabar executando o processo de "reparo" para que a nova máquina seja inicializada.
Evite isso certificando-se de que o sistema operacional está pronto para passar para o novo hardware.
A coisa mais importante a fazer é preparar o sistema operacional antes de mover o HD.