verifique as permissões do diretório do seu Desktop
ls -l ~ | grep "Desktop"
parece um problema de permissão, tente alterar as permissões com isso
sudo chmod 755 ~/Desktop -R
Estou usando o 12.04. Recentemente, notei que não posso copiar / cortar / mover arquivos na área de trabalho, a menos que eu abra o Nautilus e vá para a pasta Desktop para concluir as ações.
verifique as permissões do diretório do seu Desktop
ls -l ~ | grep "Desktop"
parece um problema de permissão, tente alterar as permissões com isso
sudo chmod 755 ~/Desktop -R
Alguns antecedentes:
Com as alterações no Ubuntu (iniciando em 11.04 ) a barra de menus do Unity (ícones, pastas, no lado esquerdo da tela) substituiu a área de trabalho como o local para ícones, lançadores, etc.
É possível obter uso limitado da área de trabalho alterando determinadas configurações, mas a intenção é não usar mais a área de trabalho para essa finalidade.
A outra alternativa é reverter / mudar para a área de trabalho do Gnome.