Para o LiDE60, existe uma opção no software do driver em que diz "Cor (48 bits)". Você o encontrará no menu suspenso "Modo de cor", logo abaixo da opção "Cor (Documentos)" e só estará disponível depois de ativar o modo de 48 bits nas preferências, como mencionado acima.
Eu não notei isso pela primeira vez, apesar de ter olhado para o menu do modo de cor. Talvez não estivesse lá, não sei. Pode ter aparecido depois que eu reiniciei o software. Mas o problema está resolvido agora. Photoshop agora me dá saída de 16 bits / RGB. Note que este é um canal de 16 bits por cor! Espero que isso seja útil para alguém.