Não ficaria surpreso se houvesse um e-mail grande ou de spam na sua caixa POP. Seu problema é um sintoma comum do cliente que está recebendo e-mails, pressionando um e-mail que não pode ser baixado e interrompido. Sugiro fazer login no lado do servidor de quem hospeda seu e-mail (webmail, por exemplo) e excluir qualquer coisa que você não precisa, em seguida, tente novamente a coleção via thunderbird.