Depende do que você chama de "seguro"?
Existe um risco de perda de dados se a fonte de alimentação falhar durante o particionamento do HDD.
Existe também o risco de que a pessoa que instala o Ubuntu remova uma partição errada ou entenda incorretamente o que é o disco. Que não é como "Disco D" no Windows. É um disco físico.
Há muitas coisas que um usuário inexperiente pode fazer de errado.
É por isso que é sempre recomendável fazer backup de seus dados importantes primeiro.
Mas se você fizer tudo com cuidado, leia os manuais primeiro, pode ser bastante seguro.
Você pode ler esta resposta para obter instruções.