Parece que o Windows precisa se estabilizar novamente após a remoção da ameaça. Eu já vi isso antes, onde pode levar alguns minutos para "reconstruir" a si mesmo. Se parecer demorar um pouco, você sempre poderá forçar um chkdsk e / ou executar o Reparo de Inicialização do Windows.
Se for um problema no driver de gráficos, você deve tentar encontrar o driver mais recente que puder.