No Finder, você pode usar Cmd-ctrl-o para abrir um arquivo ou pasta selecionado em uma nova janela. Isso funciona também em aliases: você terá o alvo aberto em uma nova janela do Finder (supondo que seja um diretório).
Usando o terminal, você pode usar o comando open /path_to/some_alias
para obter o mesmo efeito ou open /path_to_your_aliases/*
para abri-los todos em novas janelas do Finder de uma só vez. =)
Para copiar os arquivos de destino diretamente, você pode usar o Terminal ou escrever alguns AppleScript. (Uma vantagem de tal abordagem é que o processamento all dos aliases de uma vez não é mais difícil do que processar um único alias.) No entanto, supondo que os arquivos em questão sejam realmente aliases (em vez de symlinks), é um pouco complicado. Se você quiser tentar, eu posso elaborar.