Posso perguntar por que você deseja instalá-lo por meio de uma VM? O OwnCloud vem como um aplicativo da Web PHP, que pode ser facilmente instalado usando o Servidor da Web da QNAP. Atualmente tenho OwnCloud instalado no meu TS-269 Pro com este método e está funcionando perfeitamente.
Se você precisar de ajuda para isso, entre em contato.
Daxton