Fazer o backup de todas as unidades (partições) do seu sistema e incluir as bibliotecas também seria redundante.
No entanto, as bibliotecas podem incluir arquivos / diretórios de várias unidades, portanto, dependendo da sua configuração, a seleção deles também pode ou não ser redundante. Por exemplo, no seu exemplo, sua Biblioteca de documentos pode conter um diretório que resida em D: que não está selecionado no momento em seu backup, mas esse diretório em D: seria incluído por estar nessa biblioteca.
Além disso, as bibliotecas também podem incluir compartilhamentos do Windows. Na prática, não tenho certeza se eles estão incluídos no Backup do Windows, mas é perfeitamente possível que eles sejam.