Por que um diretório aparece ao visualizar a pasta inicial, mas não quando eu uso a linha de comando no Linux?

Question

É um problema estranho, quando eu navego na pasta home, vejo o diretório 'jquery', no entanto, quando eu uso a linha de comando, nada aparece. Eu usei os comandos ls | less , find . -iname jQuery , etc, mas nenhum resultado é retornado.

1. Por que isso ocorre?
2. Como posso visualizá-lo usando a linha de comando?

Estou usando o Ubuntu 12.04 LTS