slapd.conf
não está sendo usado neste caso. Em vez disso, o backend de configuração (OLC) está sendo usado sob cn=config
.
A maneira mais fácil de alterar a raiz padrão do DIT foi executar novamente a configuração:
sudo dpkg-reconfigure slapd
Responda a questão do "domínio" de forma diferente. Depois de limpar o conteúdo do LDAP antigo e reiniciar o slapd, obtive a alteração de dc = nodomain para dc = whatever.