Flash e Javascript estão executando código em sua máquina local, que é onde está o perigo. Eles podem não estar "ligando para casa" diretamente, mas o outro lado poderia estar pedindo informações que o flash ou o javascript saberiam, e assim o flash ou o javascript poderiam renunciar livremente a essas informações.
Nesse caso, nenhuma quantidade de aninhamento entre você e o destino ajudaria se o flash ou o javascript estivessem indo para "picar" você de qualquer maneira.