Isso não é diretamente uma resposta para a pergunta, mas pelo menos uma possível solução alternativa.
Primeiramente, existe um apt-get.sh no Cygwin, então você não precisa encontrar e instalar o apt-cyg.
Em segundo lugar, o Cygwin salva os espelhos que você usou:
C:\cygwin\setup
, então lembre-se de apagar e espelhar o ftp lá, e então chamar:
apt-get.sh -m THE_MIRROR_OF_YOUR_CHOICE update
Em seguida, ele salvará informações sobre esse espelho em C: \ cygwin \ setup, e parece que ele será usado por padrão, para que você não precise especificá-lo mais explicitamente. Problema resolvido, desde que aquele espelho não desça.