Ha, você acabou de descobrir outro recurso do Skype muito cuidadosamente projetado e maravilhosamente implementado !! Não é de admirar que a M $ comprasse a empresa .....
Para responder à sua pergunta, você pode alterar o dispositivo de toque padrão nas opções.
Observe que as configurações podem ser substituídas se a configuração de áudio for alterada, portanto, basta voltar lá e verificar cada vez.