Você precisa alterar a prioridade de volta ao normal enquanto o aplicativo está em execução, o que, como você descobriu, pode ser um desafio real. Isso será mais fácil se você iniciar o gerenciador de tarefas e classificar tudo por porcentagem de CPU descendente, para forçar o aplicativo para o topo da lista, antes de executar o aplicativo em questão. Em seguida, basta ter paciência para o seu sistema poupar tempo de CPU suficiente para a sua bomba de mensagens do Windows para permitir que você faça a ação.