Primeiro, remontar somente leitura e fazer backups.
Isso aconteceu comigo e eu estava convencido de que era o disco. Não era. Gostaria de verificar sua fonte de alimentação e seu protetor contra surtos e, em seguida, que você está recebendo o poder certo da fonte de energia. No meu caso, foi o protetor contra surtos / sobretensão.
EDIT: Eu reli a sua pergunta e eu não iria ignorar isso, mesmo se você fosse capaz de descompactar o arquivo. No meu caso, eu obteria md5sums diferentes no mesmo arquivo, mas eles seriam semelhantes. Arquivos pequenos normalmente retornariam a soma correta.
Exemplo:
md5sum file1 # returns abcde12345...
md5sum file1 # returns bbcde12545...
md5sum file1 # returns b1cde12395...
md5sum file1 # returns abcde12345...