Se tudo o que ele fez foi mover a pasta, em seguida, inicializar a partir de um sistema operacional de terceiros (ou seja, um LiveCD do Linux de algum tipo) e movê-lo de volta.
Desconfie de permissões de arquivo ao movê-lo.
Se foi isso que você fez quando substituiu o diretório, verifique novamente as propriedades e as permissões.