Eu ficaria muito cauteloso em fazer qualquer coisa com uso intensivo de CPU em uma instância micro. Como os recursos da CPU são sob demanda, se você fizer algo que exige muito tempo (não precisa ser esse tempo), seu poder de processamento será reduzido. Você poderá ver isso como ciclos de CPU roubados ao executar vmstat
ou top
(% st é a coluna a ser pesquisada).
Portanto, da próxima vez que o nginx não estiver respondendo, verifique se você está recebendo ciclos roubados.
Em uma instância EC2 pequena (ou melhor), os recursos da CPU são garantidos.