A maioria das ferramentas de clone e partição de drive terá opções (ou flags) para copiar dados mesmo de áreas ruins de discos ... Pessoalmente eu uso o Norton Ghost, uma versão bastante antiga (5.0c) com o "-IA - OR -FRO "sinaliza como eu inicializo em um ambiente DOS.
Já centenas de unidades clonadas ao longo dos anos, com todos os tipos de 'problemas', com muitos tipos de sistema operacional usando isso (incluindo vários Macs). Mas eu vou admitir quando eu copiei discos rígidos Mac eu fiz disco-dis > disco em um IBM-PC padrão, em seguida, coloque a (s) unidade (s) de substituição no Mac. :)
O disco de inicialização do Hiren tem muitas ferramentas de clonagem, além de gerenciadores de partição.